對葉榕是一種廣泛分布于我國南方的植物。近日，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所農(nóng)業(yè)基因組學(xué)技術(shù)研發(fā)與應(yīng)用創(chuàng)新團隊發(fā)布首個對葉榕的完整基因組，修正了此前學(xué)界對其基因組測序繪制中存在的大量間隙和組裝錯誤，大幅提升了對葉榕基因組的連續(xù)性、完整性和準(zhǔn)確性，為榕屬植物性別演化提供了重要資源。
據(jù)介紹，榕樹是桑科榕屬800多種植物的統(tǒng)稱，廣泛分布于熱帶和亞熱帶地區(qū)。榕屬植物包含6個亞屬，一半雌雄同株（單棵榕樹上包含正常的雌花和雄花），一半功能性雌雄異株（雌榕樹僅含有雌花，雄榕樹包含雄花和短花柱雌花）。其中，對葉榕是聚果榕亞屬比較古老的雌雄異株植物，具有明顯的性別分化。從生物學(xué)角度看，解析對葉榕的基因組對研究榕屬植物性別分化及相關(guān)生物學(xué)性狀和基因功能至關(guān)重要，然而，此前對葉榕基因組存在大量的信息缺失和組裝錯誤，阻礙了進一步的研究。
在國家自然科學(xué)基金等項目的支持下，科研團隊綜合利用多種測序技術(shù)，在原有基因組基礎(chǔ)上重新組裝、完善，發(fā)布了首個對葉榕所有染色體端粒到端粒完整無間隙的基因組。該基因組大小371.8兆，所有序列均掛載到14條染色體上，成功注釋了26642個編碼蛋白基因，經(jīng)評估，基因組的完整度、連續(xù)性和準(zhǔn)確性均得到了大幅提升。
另據(jù)了解，科研團隊還進一步組裝榕屬植物首個完整的性別決定區(qū)域，鑒定榕樹的性別決定基因，并構(gòu)建對葉榕雄性和雌性花不同發(fā)育時期的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，從而發(fā)現(xiàn)雄花發(fā)育的關(guān)鍵基因。（記者楊舒）