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搜索算法可助科學家發現腫瘤標志物

搜索算法可助科學家發現腫瘤標志物

2012-05-29 16:58:10

  搜索引擎不但能夠用來查找網頁,還能被用來確定腫瘤標志物。據物理學家組織網近日報道,德國德累斯頓工業大學的研究人員日前使用改良過的搜索引擎算法發現了7個腫瘤標志物,這些標志物不但可以幫助醫生對患者的病情作出準確診斷,還能幫助研究人員據此開發出新的抗癌藥物,在臨床上具有重要價值。相關論文發表在最新一期的《美國公共科學圖書館·計算生物學》上。

  此前要找到這些標志物需要經過大量的實驗,不但費時而且費力。另外一個問題是,在不同的研究中所發現的標志物總是各不相同,無法相互印證。德累斯頓工業大學的科學家發現這與搜索引擎在處理大量重復網頁和超鏈接時所遇到問題頗有幾分類似。于是他們對谷歌網頁排名(PageRank)算法進行了改造,按與胰腺癌的相關性對2萬個蛋白質進行了排序,結果從中發現了7個腫瘤標志物。這些生物標志物可以幫助醫生對癌癥早期的體液或由手術中所獲得的活體組織進行檢查,以確定患者是否需要接受化療。

  研究人員發現,一旦將網絡信息加入到分析當中,這些標志物就會變得更易重復。其中一項就與美國北卡羅來納大學早期的一項重要發現相重疊,該標志物能對胰腺癌的侵略性進行評估。

  論文第一作者克里斯托夫·文特說,雖然新的生物標志物看起來比目前所使用的更多更全面,但它們還需要經過進一步的研究和臨床試驗才能獲得應用。“但不管怎么說,我們成功邁出了第一步。”文特說。目前該研究小組已經與幾家生物技術公司展開了合作,胰腺癌藥物的臨床試驗也已逐步展開。(新華網)

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