蒙古人對當時金朝政權下的北京城也進行了殘酷的洗劫,每次攻下城后燒殺達幾個月之久,完全搶劫破壞后才撤離。公元1215年,成吉思汗攻陷金國都城中都(也就是現在的北京),對城中居民進行了長達一個月之久的大屠殺,超過100萬人為此殞命,北京這個兩三千年的古城完全消失,現在的北京沒有任何元代以前的建筑,就是這個原因。
在元代以前,中國大的民族在中原有一大分支是羌族,羌族最大的一支黨項族,作為中國一個很有影響的民族就是在西夏時被蒙古人滅絕的。現在有些姓黨的人就是黨項族人后裔。公元1227年,屠夫鐵木真發泄獸欲時,被西夏婦女咬掉了'小弟弟'而最終惡貫滿盈于六盤山。其后,他的繼承者實現了對西夏的征服。出于報復,將西夏境內的居民盡數屠戮。僅西夏都城興慶府(今銀川)就有超過80萬的居民被屠殺,黨項民族也從此滅絕于中華大地。從此羌族在中國歷史上不再有影響力。
元代蒙古人建立橫跨歐亞大陸的蒙古大帝國時,連年征戰,頻繁征兵,能征善戰的契丹族人被征召殆盡,契丹人投靠了蒙古部落,隨戰爭分散到各地,在征討大理的時候發揮了很大的作用,有很多契丹人后來就定居在了云南。還有些契丹人就是現在的達斡爾人,他們就是的契丹人后裔。這就是契丹人為什么消失的歷史之迷。
蒙古人滅花剌子模,屠尋思干(撒馬爾罕)城約百萬人口;滅西夏,屠八十余萬。蒙古人數次西征,凡遇有抵抗,立即屠城,共屠數百城。整個中亞一片廢墟。1258年,旭列兀(拖雷的兒子,忽必烈的兄弟)的蒙古鐵騎攻陷巴格達,大屠巴格達居民。據說120萬人死于屠刀下,以至底格里斯河、河水為之一片血紅!巴比倫人慘遭滅絕。蒙古人的征服過程中,滅國無數,這場屠殺是如此的酷烈,許多民族被斬盡殺絕,從而使他們徹底的湮滅于人類空前的兵兇中,典籍上對他們也只留下了只言片語的記載。
1279年,元軍與宋軍在崖山展開了最后的決戰。混戰幾天后,宋軍不支,張世杰與陸秀夫決定撤退。只是,宋軍的船隊被元軍沖散,陸秀夫不愿被俘虜,眼含淚水背著小皇帝跳海自殺,此后,殘余的宋軍、官員及家眷也紛紛跳海殉國(史載:有數萬之眾殉國),至此,南宋徹底滅亡。當時滅宋的漢奸張弘范在崖山大石上還刻有十二個大字:
鎮國大將軍張弘范滅宋于此.
不過現在多出的兩個字,就是后人加上去的"漢奸"二字。
漢奸張弘范還寫過一首詩:"磨劍劍石石鼎裂,飲馬長江江水竭。我軍百萬戰袍紅,盡是江南兒女血"。這也說明了當時戰況和屠殺的慘烈。
遺落在福建一帶的南宋遺民,他們的后人就是現在的閩南客家人。
蒙古兵所到之處,想盡一些辦法把當地人口殺干凈。除了直接屠殺,還焚燒所有的糧倉和房屋,使得逃走的百姓在冬天凍死,踐踏破壞農田和灌溉系統,使得當地人以后完全沒有食物來源而餓死。用腐爛的尸體去污染水源,使得大量人口飲水后染上疾病而死亡。把老百姓趕到海里淹死。有些地方有幸存者,那是因為蒙古軍隊人少,一時找不到他們,或者是急著要出征別處,即使沒有來的及殺完,也就出征了,一點也不能說明那些屠夫有半點殘余的良心。被屠殺城市的幸存者也住不滿城市一角。根據蒙古征服前和征服后人口數量推測蒙古人至少殺了多少人。很多中外歷史學家推測,中國北方至少有80%人口在蒙古入侵時死于非命。成吉思汗的有句名言:"男子漢人生最快樂的事,就是殺人性命,奪盡其所有財產,使其根絕,令其親屬痛哭,再奸淫其妻女"。蒙古帝國在中國境內的種族滅絕,作為世界記錄放在《吉尼斯世界記錄大全》1985年版。
那些來自蒙古的征服者似乎不認為在自己統治下的老百姓是人,他們甚至經常考慮把這些占地方的家伙都殺掉,然后把土地用來放牧(元史)。中國人甚至連姓名都不能有,只能以出生日期為名,不能擁有武器,只能幾家合用一把菜刀,漢人村里新媳婦的頭一夜一定要給蒙古保長。在這種淫威下,漢民族有了一次大規模的向東南亞的外遷。